普通的上班族藤木户健二，他的妻子在忍者斗争中丧命。在他濒死之际，竟然被神祕的忍者灵魂附身了！捡回一命的藤木户，从此成为“忍者终结者”，专门终结忍者，为了复仇而战！以近未来都市新埼玉为舞台，忍者

　　　　鸣海幸树表面看来只是一个平凡的学生，实际上却是在漫画周刊上登有连载作品的漫画原作者。一次偶然中，幸树的真实身份被学生会长鹿苑寺薰子（樱乃灯代 配音）给发现了，作为保守秘密的交换条件，幸树加入了

　　　　史雷（木村良平 配音）虽然身为人类，却在天族的养育下长大。人类无法感知到天族的存在，可史雷却因为其拥有的强大灵力而让这两个格格不入的种族产生了交集。为了解开遗迹崩塌的谜团，为了推进历史的前进，

　　　　故事发生在名为“风祭”的都市之中，天王寺瑚太朗（森田成一 配音）是一名平凡的高中生，过着风平浪静的生活。一年一度的收获祭即将到来，这个热闹欢快的祭典让整个城市都陷入了欢乐而躁动的海洋之中。