故事讲述距离《圣斗士星矢》本篇所处年代 (ND里说明是1990年) 的243年之前的圣战的故事。出场人物有在本篇里是前圣战残存者的黄金圣斗士的童虎和史昂、这个时代的天马星座圣斗士·天马、天马的挚友·被

　　居于轩辕宫的青云帝无意中惹恼水灵，人间洪水泛滥，青云帝选出人间十二种动物为生肖，救百姓于水火之中。经过重重遴选，鼠、牛、虎、兔、龙、蛇、马、羊、猴、鸡、狗、猪十二种动物荣幸当选为十二生肖，飞升天庭